Le territoire de l’actuelle Estonie a été marqué au cours de son histoire par les influences danoise, allemande, polonaise, suédoise, puis russe jusqu’à l’indépendance obtenue à la fin de la Première Guerre mondiale.
Au cours des XVIe et XVIIe siècles la Suède prit possession de l’Estonie du nord et de la Livonie.
Le traité de paix de Nystad signé le 10 septembre 1721 entre la Suède et la Russie marque la fin de la Grande Guerre du Nord (1700-1721) et le début de deux siècles de domination russe.

Carte extraite de l’atlas Stielers de 1908. La ligne rouge représente les frontières actuelles de l’Estonie.

L’indépendance est proclamée le 24 février 1918. Le traité de Tartu du 2 février 1920 (1) fixe le tracé de la frontière et officialise la reconnaissance de l’indépendance de l’Estonie par la Russie bolchevique.
Une clause secrète du pacte de non agression germano-soviétique (23 août 1939) place l’Estonie dans la zone d’influence de l’Union soviétique.
Le 15 juin 1940 l’Armée rouge entre en Estonie. L’URSS annexe le pays le 21 juin qui devient la République socialiste soviétique d’Estonie, décision approuvée par le soviet suprême d’URSS le 6 août 1940.

De juillet 1941 à octobre 1944, c’est l’Allemagne nazie qui occupe le pays.
La RSS d’Estonie a été restaurée à l’automne 1944.

En janvier 1945, l’URSS transféra 2000km2 de la RSS d’Estonie vers la RSS de Russie:
• une bande de terre d’environs 12km à l’est de la rivière Narva incluant la ville d’Ivangorod,
• la région de Petseri. À présent le raïon (district) de Pechory constitue une des vingt-quatre subdivisions de l’oblast de Pskov.

Le 20 août 1990 la deuxième indépendance est proclamée, elle sera reconnue par Moscou le 6 septembre 1991. La frontière actuelle entre l’Estonie et la Russie est celle qui a été tracée en 1945.

Après l’indépendance de 1991, l’Estonie tenta de récupérer le territoire perdu en 1945 en faisant valoir une clause du traité de Tartu qui stipulait que la Russie renonçait à toute prétention territoriale en Estonie.
Face au refus des autorités russes, l’Estonie abandonna ses revendications et signa un traité frontalier avec la Russie le 18 mai 2005. Ce traité fut dénoncé par la Russie le 27 juin 2005 car un amendement faisant référence à l’occupation soviétique avait été ajouté au préambule par le Parlement estonien.
Après de longues négociations entre les deux pays, le Parlement estonien a approuvé en mai 2013 un projet de traité sur la frontière russo-estonienne et la délimitation des eaux territoriales dans le golfe de Finlande. L’accord a finalement été signé dans la capitale russe le 18 février 2014 par le chef de la diplomatie estonienne, Urmas Paet, et son homologue russe Sergueï Lavrov.  

(1) À ne pas confondre avec le traité signé avec la Finlande le 14 octobre 1920.